中国科学院亚热带农业生态研究所淮安研发中心建于2012年，是在淮安市产学研合作重大创新载体建设项目资金资助下由淮安市政府、中科院亚热带农业生态研究所、江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所联合成立的科研创新平台，是政产学研合作成果。研发中心主要发挥中科院亚热带农业生态研究所在农业生态研究方面、江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所在农业应用基础研究方面的优势，主要在作物生态育种、作物种质资源创新与利用、作物清洁生产、生态农业产品研发等方面开展研究。